Schwerpunkte:

Interdisziplinäres Lehren und Lernen

• Interkulturalität im inklusiven Religionsunterricht
• Ästhetik und Religionspädagogik fachwissenschaftlich und fachdidaktisch 
• Musikästhetik und Theologie
• Emotionales Lernen durch Musik im Religionsunterricht 
• Auditive Wahrnehmungserziehung im RU

Religiöse Bildung und Erziehung in Europa unter evangelischer Verantwortung 

• Europäische Standards zu einer "Religious Literacy" und
• ihre Theologie in bildungstheoretischer Verortung
• Zur interkulturellen Verständigung und Werteerziehung in Europa 
• im Kontext einer kritischen Gegenwartsanalyse in Sachen Religion

Grundlagenforschung für Bildungsstandards des Religionsunterrichts

• Bildungstheorie der Bildungsstandards für den Religionsunterricht 
• Pädagogische Bildungsforschung und Religiöse Grundbildung
• "Religious Literacy" und gebildeter Glaube 
• Zwischen gesellschaftlicher Funktion und individueller Freiheit –
  Religion und Bildung heute aus evangelischer Perspektive

Forschungen im Bereich der Toleranz- und Friedenserziehung

• Religionspädagogik ökumenisch - interkulturell - interreligiös
• Politische Friedensarbeit und interreligiöser Dialog
• Ökumenisches Lernen in der Schule – Deutefähigkeit und Partizipationskompetenz
• Interreligiöses Lernen im Pluralismus der Weltdeutungen heute

Laufendes Forschungsprojekt

• Mit Prof. Dr. Mirjam Zimmermann ist Prof. Dr. Heike Lindner Hauptherausgeberin des frei zugänglichen Internet-Lexikons WiReLex (Wissenschaftlich-Religionspädagogisches Lexikon www.wirelex.de). WiReLex hat ein Alleinstellungsmerkmal,
  - weil es das erste Wissenschaftlich-Religionspädagogische Lexikon (WiReLex) im Internet ist (für den deutschsprachigen Raum, international evtl. sogar auch),
  - weil es ökumenisch konzipiert wurde,
  - und weil es eine hochgradige Vernetzung von wissenschaftlich orientierten ReligionspädagogInnen darstellt, welche für den 2. Jahrgang mit bereits 200 Artikeln auf die Beine gestellt wurde.
  
  Es enthält wichtige Stichworte zu Religion, Pädagogik und Gesellschaft und hebt sich als ein wissenschaftliches Lexikon von anderen Internet-Lexika ab. Es wendet sich sowohl an das Fachpublikum, aber auch an Menschen, die in religionspädagogischen Einrichtungen tätig sind (wie z. B. Schulen, Kindergärten, Gemeindepädagogik, kirchliche Akademien, Einrichtungen der Erwachsenenpädagogik etc.), aber auch Studierende und Referendare.  Nähere Informationen hier.